Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEFA3P59666 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEFA3P59666 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEFA3P59666 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEFA3P59666 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEFA3P59666 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEFA3P59666 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEFA3P59666 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DEFA3P59666 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEFA3P59666 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEFA3P59666 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEFA3P59666 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEFA3P59666 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEFA3P59666 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEFA3P59666 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEFA3P59666 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DEFA3P59666 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEFA3P59666 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEFA3P59666 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEFA3P59666 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEFA3P59666 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEFA3P59666 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEFA3P59666 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEFA3P59666 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEFA3P59666 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEFA3P59666 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEFA3P59666 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEFA3P59666 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEFA3P59666 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DEFA3P59666 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEFA3P59666 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEFA3P59666 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEFA3P59666 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEFA3P59666 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEFA3P59666 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DEFA3P59666 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DEFA3P59666 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEFA3P59666 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEFA3P59666 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEFA3P59666 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEFA3P59666 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEFA3P59666 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEFA3P59666 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEFA3P59666 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEFA3P59666 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEFA3P59666 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEFA3P59666 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEFA3P59666 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFA3P59666 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFA3P59666 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFA3P59666 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFA3P59666 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFA3P59666 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEFA3P59666 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEFA3P59666 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEFA3P59666 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEFA3P59666 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEFA3P59666 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEFA3P59666 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEFA3P59666 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEFA3P59666 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEFA3P59666 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEFA3P59666 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEFA3P59666 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEFA3P59666 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEFA3P59666 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEFA3P59666 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEFA3P59666 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEFA3P59666 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEFA3P59666 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEFA3P59666 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms