Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEFA1P59665 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEFA1P59665 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEFA1P59665 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEFA1P59665 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEFA1P59665 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEFA1P59665 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEFA1P59665 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DEFA1P59665 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEFA1P59665 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEFA1P59665 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEFA1P59665 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEFA1P59665 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEFA1P59665 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEFA1P59665 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEFA1P59665 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DEFA1P59665 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEFA1P59665 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEFA1P59665 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEFA1P59665 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEFA1P59665 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEFA1P59665 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEFA1P59665 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEFA1P59665 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEFA1P59665 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEFA1P59665 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEFA1P59665 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEFA1P59665 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEFA1P59665 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DEFA1P59665 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEFA1P59665 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEFA1P59665 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEFA1P59665 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEFA1P59665 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEFA1P59665 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DEFA1P59665 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DEFA1P59665 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEFA1P59665 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEFA1P59665 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEFA1P59665 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEFA1P59665 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEFA1P59665 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEFA1P59665 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEFA1P59665 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEFA1P59665 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEFA1P59665 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEFA1P59665 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEFA1P59665 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFA1P59665 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFA1P59665 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFA1P59665 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFA1P59665 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFA1P59665 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEFA1P59665 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEFA1P59665 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEFA1P59665 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEFA1P59665 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEFA1P59665 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEFA1P59665 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEFA1P59665 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEFA1P59665 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEFA1P59665 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEFA1P59665 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEFA1P59665 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEFA1P59665 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEFA1P59665 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEFA1P59665 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEFA1P59665 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEFA1P59665 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEFA1P59665 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEFA1P59665 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms