Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00315P59091 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00315P59091 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00315P59091 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00315P59091 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00315P59091 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00315P59091 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00315P59091 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00315P59091 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00315P59091 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00315P59091 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00315P59091 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00315P59091 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00315P59091 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00315P59091 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00315P59091 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00315P59091 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00315P59091 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00315P59091 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00315P59091 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00315P59091 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00315P59091 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00315P59091 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00315P59091 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00315P59091 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00315P59091 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00315P59091 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00315P59091 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00315P59091 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00315P59091 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00315P59091 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00315P59091 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00315P59091 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00315P59091 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00315P59091 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00315P59091 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00315P59091 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00315P59091 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00315P59091 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00315P59091 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00315P59091 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00315P59091 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms