Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PER3P56645 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PER3P56645 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PER3P56645 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PER3P56645 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PER3P56645 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PER3P56645 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PER3P56645 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PER3P56645 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PER3P56645 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PER3P56645 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PER3P56645 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PER3P56645 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PER3P56645 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PER3P56645 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PER3P56645 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PER3P56645 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PER3P56645 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PER3P56645 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PER3P56645 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PER3P56645 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PER3P56645 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PER3P56645 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PER3P56645 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PER3P56645 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PER3P56645 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PER3P56645 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PER3P56645 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PER3P56645 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PER3P56645 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PER3P56645 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PER3P56645 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PER3P56645 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PER3P56645 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PER3P56645 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PER3P56645 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PER3P56645 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PER3P56645 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PER3P56645 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PER3P56645 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PER3P56645 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PER3P56645 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PER3P56645 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PER3P56645 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PER3P56645 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PER3P56645 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PER3P56645 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PER3P56645 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PER3P56645 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PER3P56645 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PER3P56645 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PER3P56645 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PER3P56645 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PER3P56645 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PER3P56645 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PER3P56645 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PER3P56645 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PER3P56645 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PER3P56645 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PER3P56645 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PER3P56645 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PER3P56645 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PER3P56645 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PER3P56645 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PER3P56645 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PER3P56645 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PER3P56645 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PER3P56645 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PER3P56645 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PER3P56645 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PER3P56645 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PER3P56645 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PER3P56645 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PER3P56645 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PER3P56645 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PER3P56645 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PER3P56645 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PER3P56645 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PER3P56645 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PER3P56645 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PER3P56645 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PER3P56645 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PER3P56645 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PER3P56645 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PER3P56645 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PER3P56645 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PER3P56645 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PER3P56645 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PER3P56645 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PER3P56645 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PER3P56645 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PER3P56645 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PER3P56645 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PER3P56645 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PER3P56645 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PER3P56645 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PER3P56645 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PER3P56645 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PER3P56645 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PER3P56645 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms