Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BRPF1P55201 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
BRPF1P55201 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BRPF1P55201 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
BRPF1P55201 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
BRPF1P55201 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
BRPF1P55201 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
BRPF1P55201 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BRPF1P55201 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
BRPF1P55201 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
BRPF1P55201 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
BRPF1P55201 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
BRPF1P55201 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
BRPF1P55201 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
BRPF1P55201 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
BRPF1P55201 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
BRPF1P55201 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
BRPF1P55201 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
BRPF1P55201 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BRPF1P55201 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
BRPF1P55201 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
BRPF1P55201 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BRPF1P55201 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BRPF1P55201 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BRPF1P55201 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
BRPF1P55201 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BRPF1P55201 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
BRPF1P55201 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BRPF1P55201 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BRPF1P55201 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BRPF1P55201 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BRPF1P55201 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BRPF1P55201 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
BRPF1P55201 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
BRPF1P55201 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
BRPF1P55201 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
BRPF1P55201 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BRPF1P55201 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
BRPF1P55201 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
BRPF1P55201 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
BRPF1P55201 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
BRPF1P55201 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
BRPF1P55201 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
BRPF1P55201 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
BRPF1P55201 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
BRPF1P55201 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
BRPF1P55201 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
BRPF1P55201 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
BRPF1P55201 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
BRPF1P55201 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
BRPF1P55201 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
BRPF1P55201 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
BRPF1P55201 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BRPF1P55201 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
BRPF1P55201 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
BRPF1P55201 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
BRPF1P55201 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
BRPF1P55201 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
BRPF1P55201 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BRPF1P55201 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BRPF1P55201 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BRPF1P55201 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BRPF1P55201 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BRPF1P55201 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRPF1P55201 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRPF1P55201 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BRPF1P55201 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BRPF1P55201 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BRPF1P55201 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BRPF1P55201 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
BRPF1P55201 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
BRPF1P55201 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BRPF1P55201 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BRPF1P55201 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BRPF1P55201 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
BRPF1P55201 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BRPF1P55201 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BRPF1P55201 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
BRPF1P55201 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BRPF1P55201 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BRPF1P55201 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
BRPF1P55201 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
BRPF1P55201 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BRPF1P55201 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
BRPF1P55201 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BRPF1P55201 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BRPF1P55201 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms