Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
BLMP54132 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
BLMP54132 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
BLMP54132 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
BLMP54132 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
BLMP54132 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
BLMP54132 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
BLMP54132 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
BLMP54132 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
BLMP54132 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
BLMP54132 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
BLMP54132 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
BLMP54132 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
BLMP54132 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
BLMP54132 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
BLMP54132 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
BLMP54132 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
BLMP54132 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
BLMP54132 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
BLMP54132 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
BLMP54132 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
BLMP54132 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
BLMP54132 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
BLMP54132 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
BLMP54132 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
BLMP54132 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
BLMP54132 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.18■■■■□ 3.7
BLMP54132 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
BLMP54132 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
BLMP54132 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
BLMP54132 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
BLMP54132 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
BLMP54132 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
BLMP54132 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
BLMP54132 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
BLMP54132 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
BLMP54132 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
BLMP54132 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
BLMP54132 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
BLMP54132 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
BLMP54132 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
BLMP54132 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
BLMP54132 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BLMP54132 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
BLMP54132 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
BLMP54132 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
BLMP54132 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
BLMP54132 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BLMP54132 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BLMP54132 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
BLMP54132 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BLMP54132 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
BLMP54132 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
BLMP54132 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
BLMP54132 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
BLMP54132 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
BLMP54132 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BLMP54132 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
BLMP54132 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
BLMP54132 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
BLMP54132 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
BLMP54132 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
BLMP54132 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
BLMP54132 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
BLMP54132 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
BLMP54132 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
BLMP54132 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
BLMP54132 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
BLMP54132 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
BLMP54132 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
BLMP54132 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BLMP54132 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
BLMP54132 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
BLMP54132 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
BLMP54132 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
BLMP54132 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
BLMP54132 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
BLMP54132 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
BLMP54132 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
BLMP54132 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
BLMP54132 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
BLMP54132 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
BLMP54132 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
BLMP54132 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
BLMP54132 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
BLMP54132 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
BLMP54132 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
BLMP54132 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
BLMP54132 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
BLMP54132 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
BLMP54132 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
BLMP54132 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
BLMP54132 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
BLMP54132 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
BLMP54132 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
BLMP54132 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
BLMP54132 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
BLMP54132 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
BLMP54132 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
BLMP54132 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms