Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC24CP53992 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC24CP53992 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC24CP53992 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC24CP53992 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC24CP53992 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC24CP53992 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC24CP53992 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC24CP53992 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC24CP53992 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC24CP53992 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC24CP53992 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC24CP53992 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC24CP53992 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC24CP53992 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC24CP53992 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC24CP53992 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC24CP53992 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24CP53992 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24CP53992 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24CP53992 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC24CP53992 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC24CP53992 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC24CP53992 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC24CP53992 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC24CP53992 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC24CP53992 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC24CP53992 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEC24CP53992 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEC24CP53992 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC24CP53992 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC24CP53992 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC24CP53992 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC24CP53992 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC24CP53992 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC24CP53992 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24CP53992 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24CP53992 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24CP53992 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24CP53992 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC24CP53992 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24CP53992 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24CP53992 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC24CP53992 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SEC24CP53992 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC24CP53992 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24CP53992 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24CP53992 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC24CP53992 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC24CP53992 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC24CP53992 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC24CP53992 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24CP53992 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24CP53992 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24CP53992 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC24CP53992 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC24CP53992 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC24CP53992 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24CP53992 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24CP53992 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC24CP53992 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC24CP53992 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24CP53992 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SEC24CP53992 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24CP53992 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SEC24CP53992 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24CP53992 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SEC24CP53992 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24CP53992 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24CP53992 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC24CP53992 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC24CP53992 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC24CP53992 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC24CP53992 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SEC24CP53992 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24CP53992 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24CP53992 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC24CP53992 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC24CP53992 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24CP53992 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24CP53992 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC24CP53992 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC24CP53992 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC24CP53992 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC24CP53992 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24CP53992 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC24CP53992 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC24CP53992 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms