Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC5A3P53794 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC5A3P53794 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC5A3P53794 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A3P53794 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A3P53794 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC5A3P53794 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC5A3P53794 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC5A3P53794 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A3P53794 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC5A3P53794 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC5A3P53794 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC5A3P53794 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC5A3P53794 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC5A3P53794 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC5A3P53794 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC5A3P53794 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC5A3P53794 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC5A3P53794 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC5A3P53794 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC5A3P53794 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC5A3P53794 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC5A3P53794 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A3P53794 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A3P53794 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A3P53794 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A3P53794 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A3P53794 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A3P53794 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC5A3P53794 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A3P53794 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A3P53794 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A3P53794 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A3P53794 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC5A3P53794 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC5A3P53794 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A3P53794 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A3P53794 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A3P53794 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A3P53794 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A3P53794 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC5A3P53794 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC5A3P53794 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC5A3P53794 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC5A3P53794 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A3P53794 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A3P53794 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A3P53794 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A3P53794 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC5A3P53794 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC5A3P53794 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC5A3P53794 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC5A3P53794 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC5A3P53794 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC5A3P53794 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC5A3P53794 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC5A3P53794 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC5A3P53794 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC5A3P53794 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC5A3P53794 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC5A3P53794 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC5A3P53794 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC5A3P53794 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC5A3P53794 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC5A3P53794 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC5A3P53794 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC5A3P53794 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC5A3P53794 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC5A3P53794 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC5A3P53794 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC5A3P53794 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC5A3P53794 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC5A3P53794 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC5A3P53794 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC5A3P53794 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC5A3P53794 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC5A3P53794 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC5A3P53794 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC5A3P53794 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC5A3P53794 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC5A3P53794 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC5A3P53794 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC5A3P53794 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC5A3P53794 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC5A3P53794 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC5A3P53794 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC5A3P53794 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms