Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLCN6P51797 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLCN6P51797 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLCN6P51797 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLCN6P51797 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLCN6P51797 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CLCN6P51797 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLCN6P51797 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLCN6P51797 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLCN6P51797 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLCN6P51797 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLCN6P51797 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLCN6P51797 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLCN6P51797 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLCN6P51797 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CLCN6P51797 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLCN6P51797 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLCN6P51797 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLCN6P51797 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLCN6P51797 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLCN6P51797 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CLCN6P51797 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLCN6P51797 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLCN6P51797 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLCN6P51797 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLCN6P51797 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLCN6P51797 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLCN6P51797 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLCN6P51797 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLCN6P51797 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLCN6P51797 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLCN6P51797 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLCN6P51797 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLCN6P51797 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLCN6P51797 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCN6P51797 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCN6P51797 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCN6P51797 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCN6P51797 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCN6P51797 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCN6P51797 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLCN6P51797 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLCN6P51797 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLCN6P51797 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN6P51797 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN6P51797 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN6P51797 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN6P51797 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLCN6P51797 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLCN6P51797 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN6P51797 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN6P51797 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN6P51797 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN6P51797 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN6P51797 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLCN6P51797 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCN6P51797 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLCN6P51797 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLCN6P51797 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLCN6P51797 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLCN6P51797 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLCN6P51797 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CLCN6P51797 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLCN6P51797 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms