Protein–RNA interactions for Protein: P49750

YLPM1, YLP motif-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YLPM1P49750 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YLPM1P49750 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YLPM1P49750 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YLPM1P49750 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YLPM1P49750 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YLPM1P49750 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YLPM1P49750 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YLPM1P49750 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YLPM1P49750 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YLPM1P49750 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YLPM1P49750 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YLPM1P49750 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YLPM1P49750 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YLPM1P49750 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YLPM1P49750 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YLPM1P49750 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YLPM1P49750 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YLPM1P49750 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
YLPM1P49750 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YLPM1P49750 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YLPM1P49750 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YLPM1P49750 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YLPM1P49750 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YLPM1P49750 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YLPM1P49750 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YLPM1P49750 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YLPM1P49750 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YLPM1P49750 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YLPM1P49750 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YLPM1P49750 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YLPM1P49750 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YLPM1P49750 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YLPM1P49750 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
YLPM1P49750 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YLPM1P49750 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YLPM1P49750 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YLPM1P49750 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YLPM1P49750 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YLPM1P49750 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YLPM1P49750 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YLPM1P49750 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YLPM1P49750 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YLPM1P49750 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YLPM1P49750 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YLPM1P49750 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YLPM1P49750 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YLPM1P49750 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YLPM1P49750 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YLPM1P49750 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YLPM1P49750 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YLPM1P49750 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YLPM1P49750 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YLPM1P49750 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YLPM1P49750 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YLPM1P49750 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YLPM1P49750 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YLPM1P49750 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YLPM1P49750 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YLPM1P49750 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YLPM1P49750 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YLPM1P49750 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YLPM1P49750 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YLPM1P49750 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YLPM1P49750 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
YLPM1P49750 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YLPM1P49750 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
YLPM1P49750 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
YLPM1P49750 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YLPM1P49750 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YLPM1P49750 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YLPM1P49750 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
YLPM1P49750 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
YLPM1P49750 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YLPM1P49750 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YLPM1P49750 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YLPM1P49750 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YLPM1P49750 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YLPM1P49750 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YLPM1P49750 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YLPM1P49750 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms