Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD8P48556 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD8P48556 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMD8P48556 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD8P48556 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD8P48556 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD8P48556 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD8P48556 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD8P48556 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD8P48556 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD8P48556 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD8P48556 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMD8P48556 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMD8P48556 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD8P48556 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD8P48556 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD8P48556 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD8P48556 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD8P48556 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD8P48556 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD8P48556 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD8P48556 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD8P48556 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD8P48556 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD8P48556 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD8P48556 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD8P48556 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD8P48556 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD8P48556 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD8P48556 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD8P48556 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD8P48556 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD8P48556 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD8P48556 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD8P48556 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD8P48556 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD8P48556 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD8P48556 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD8P48556 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSMD8P48556 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD8P48556 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD8P48556 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD8P48556 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD8P48556 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD8P48556 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD8P48556 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD8P48556 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD8P48556 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD8P48556 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD8P48556 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD8P48556 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD8P48556 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD8P48556 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD8P48556 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD8P48556 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD8P48556 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD8P48556 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD8P48556 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD8P48556 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD8P48556 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD8P48556 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD8P48556 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD8P48556 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD8P48556 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD8P48556 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD8P48556 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD8P48556 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD8P48556 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD8P48556 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD8P48556 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms