Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTGER3P43115 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTGER3P43115 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTGER3P43115 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER3P43115 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER3P43115 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGER3P43115 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGER3P43115 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER3P43115 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER3P43115 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER3P43115 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGER3P43115 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGER3P43115 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGER3P43115 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGER3P43115 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGER3P43115 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGER3P43115 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER3P43115 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER3P43115 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGER3P43115 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGER3P43115 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGER3P43115 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGER3P43115 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGER3P43115 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGER3P43115 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGER3P43115 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGER3P43115 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGER3P43115 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGER3P43115 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER3P43115 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER3P43115 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER3P43115 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGER3P43115 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGER3P43115 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGER3P43115 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGER3P43115 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGER3P43115 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGER3P43115 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGER3P43115 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGER3P43115 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGER3P43115 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGER3P43115 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGER3P43115 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGER3P43115 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGER3P43115 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGER3P43115 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGER3P43115 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGER3P43115 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTGER3P43115 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTGER3P43115 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTGER3P43115 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTGER3P43115 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGER3P43115 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGER3P43115 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGER3P43115 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTGER3P43115 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTGER3P43115 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTGER3P43115 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTGER3P43115 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTGER3P43115 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGER3P43115 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGER3P43115 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGER3P43115 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGER3P43115 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGER3P43115 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTGER3P43115 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGER3P43115 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGER3P43115 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGER3P43115 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGER3P43115 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTGER3P43115 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTGER3P43115 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGER3P43115 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGER3P43115 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTGER3P43115 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTGER3P43115 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms