Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC1A3P43003 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A3P43003 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A3P43003 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A3P43003 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A3P43003 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A3P43003 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A3P43003 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A3P43003 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A3P43003 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A3P43003 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A3P43003 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A3P43003 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A3P43003 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A3P43003 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A3P43003 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A3P43003 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A3P43003 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A3P43003 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A3P43003 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A3P43003 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A3P43003 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A3P43003 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A3P43003 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A3P43003 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A3P43003 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A3P43003 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A3P43003 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A3P43003 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A3P43003 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A3P43003 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A3P43003 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A3P43003 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A3P43003 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A3P43003 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A3P43003 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A3P43003 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A3P43003 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A3P43003 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A3P43003 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A3P43003 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A3P43003 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A3P43003 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A3P43003 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A3P43003 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A3P43003 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A3P43003 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A3P43003 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A3P43003 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A3P43003 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A3P43003 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A3P43003 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A3P43003 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A3P43003 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A3P43003 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A3P43003 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A3P43003 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A3P43003 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A3P43003 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A3P43003 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A3P43003 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A3P43003 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms