Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC6A4P31645 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC6A4P31645 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC6A4P31645 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC6A4P31645 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC6A4P31645 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC6A4P31645 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC6A4P31645 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC6A4P31645 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC6A4P31645 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC6A4P31645 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC6A4P31645 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC6A4P31645 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC6A4P31645 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC6A4P31645 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC6A4P31645 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC6A4P31645 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC6A4P31645 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC6A4P31645 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC6A4P31645 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC6A4P31645 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC6A4P31645 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC6A4P31645 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC6A4P31645 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC6A4P31645 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC6A4P31645 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC6A4P31645 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC6A4P31645 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC6A4P31645 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC6A4P31645 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC6A4P31645 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC6A4P31645 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC6A4P31645 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC6A4P31645 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC6A4P31645 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC6A4P31645 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC6A4P31645 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC6A4P31645 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC6A4P31645 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC6A4P31645 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC6A4P31645 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC6A4P31645 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC6A4P31645 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC6A4P31645 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC6A4P31645 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC6A4P31645 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC6A4P31645 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC6A4P31645 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC6A4P31645 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC6A4P31645 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC6A4P31645 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC6A4P31645 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC6A4P31645 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC6A4P31645 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC6A4P31645 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC6A4P31645 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC6A4P31645 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC6A4P31645 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC6A4P31645 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC6A4P31645 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC6A4P31645 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC6A4P31645 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC6A4P31645 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC6A4P31645 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC6A4P31645 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC6A4P31645 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC6A4P31645 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC6A4P31645 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC6A4P31645 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC6A4P31645 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC6A4P31645 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC6A4P31645 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC6A4P31645 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC6A4P31645 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC6A4P31645 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC6A4P31645 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms