Protein–RNA interactions for Protein: P29401

TKT, Transketolase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TKTP29401 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TKTP29401 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TKTP29401 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TKTP29401 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TKTP29401 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TKTP29401 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TKTP29401 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TKTP29401 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TKTP29401 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TKTP29401 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TKTP29401 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TKTP29401 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TKTP29401 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TKTP29401 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TKTP29401 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TKTP29401 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TKTP29401 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TKTP29401 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TKTP29401 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TKTP29401 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TKTP29401 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TKTP29401 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TKTP29401 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TKTP29401 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TKTP29401 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TKTP29401 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TKTP29401 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TKTP29401 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TKTP29401 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TKTP29401 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TKTP29401 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TKTP29401 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TKTP29401 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TKTP29401 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TKTP29401 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TKTP29401 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TKTP29401 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TKTP29401 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TKTP29401 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TKTP29401 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TKTP29401 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TKTP29401 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TKTP29401 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TKTP29401 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TKTP29401 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TKTP29401 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TKTP29401 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TKTP29401 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TKTP29401 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TKTP29401 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TKTP29401 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TKTP29401 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TKTP29401 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TKTP29401 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TKTP29401 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TKTP29401 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TKTP29401 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TKTP29401 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TKTP29401 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TKTP29401 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TKTP29401 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TKTP29401 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TKTP29401 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TKTP29401 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TKTP29401 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TKTP29401 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TKTP29401 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TKTP29401 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TKTP29401 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TKTP29401 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TKTP29401 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TKTP29401 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TKTP29401 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TKTP29401 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TKTP29401 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TKTP29401 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TKTP29401 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TKTP29401 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TKTP29401 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TKTP29401 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TKTP29401 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TKTP29401 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TKTP29401 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TKTP29401 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TKTP29401 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TKTP29401 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TKTP29401 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TKTP29401 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TKTP29401 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TKTP29401 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TKTP29401 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TKTP29401 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TKTP29401 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TKTP29401 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TKTP29401 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TKTP29401 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TKTP29401 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TKTP29401 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TKTP29401 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TKTP29401 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms