Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APEX1P27695 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APEX1P27695 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APEX1P27695 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APEX1P27695 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APEX1P27695 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APEX1P27695 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APEX1P27695 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX1P27695 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX1P27695 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX1P27695 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX1P27695 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APEX1P27695 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APEX1P27695 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APEX1P27695 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APEX1P27695 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX1P27695 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX1P27695 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX1P27695 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX1P27695 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX1P27695 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX1P27695 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APEX1P27695 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APEX1P27695 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APEX1P27695 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APEX1P27695 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APEX1P27695 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APEX1P27695 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APEX1P27695 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APEX1P27695 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APEX1P27695 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APEX1P27695 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APEX1P27695 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APEX1P27695 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APEX1P27695 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APEX1P27695 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APEX1P27695 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APEX1P27695 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APEX1P27695 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APEX1P27695 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APEX1P27695 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APEX1P27695 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX1P27695 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX1P27695 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX1P27695 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX1P27695 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX1P27695 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX1P27695 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX1P27695 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX1P27695 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APEX1P27695 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX1P27695 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APEX1P27695 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX1P27695 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX1P27695 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX1P27695 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX1P27695 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APEX1P27695 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APEX1P27695 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX1P27695 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX1P27695 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX1P27695 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX1P27695 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APEX1P27695 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APEX1P27695 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APEX1P27695 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX1P27695 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX1P27695 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX1P27695 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX1P27695 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APEX1P27695 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APEX1P27695 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APEX1P27695 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APEX1P27695 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APEX1P27695 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APEX1P27695 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APEX1P27695 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APEX1P27695 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APEX1P27695 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX1P27695 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX1P27695 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX1P27695 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX1P27695 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APEX1P27695 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APEX1P27695 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APEX1P27695 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX1P27695 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX1P27695 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX1P27695 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX1P27695 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX1P27695 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX1P27695 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APEX1P27695 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APEX1P27695 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APEX1P27695 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APEX1P27695 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX1P27695 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX1P27695 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX1P27695 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX1P27695 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms