Protein–RNA interactions for Protein: P27037

ACVR2A, Activin receptor type-2A, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR2AP27037 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACVR2AP27037 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACVR2AP27037 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACVR2AP27037 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACVR2AP27037 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACVR2AP27037 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACVR2AP27037 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACVR2AP27037 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACVR2AP27037 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACVR2AP27037 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACVR2AP27037 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACVR2AP27037 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACVR2AP27037 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACVR2AP27037 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACVR2AP27037 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACVR2AP27037 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACVR2AP27037 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACVR2AP27037 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACVR2AP27037 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACVR2AP27037 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACVR2AP27037 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACVR2AP27037 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACVR2AP27037 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACVR2AP27037 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACVR2AP27037 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACVR2AP27037 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACVR2AP27037 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACVR2AP27037 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACVR2AP27037 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACVR2AP27037 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACVR2AP27037 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACVR2AP27037 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACVR2AP27037 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACVR2AP27037 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACVR2AP27037 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACVR2AP27037 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACVR2AP27037 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACVR2AP27037 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ACVR2AP27037 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ACVR2AP27037 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACVR2AP27037 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACVR2AP27037 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACVR2AP27037 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACVR2AP27037 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACVR2AP27037 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACVR2AP27037 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACVR2AP27037 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACVR2AP27037 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ACVR2AP27037 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACVR2AP27037 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACVR2AP27037 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACVR2AP27037 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACVR2AP27037 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACVR2AP27037 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACVR2AP27037 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACVR2AP27037 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACVR2AP27037 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACVR2AP27037 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACVR2AP27037 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACVR2AP27037 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACVR2AP27037 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACVR2AP27037 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACVR2AP27037 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACVR2AP27037 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACVR2AP27037 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACVR2AP27037 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACVR2AP27037 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACVR2AP27037 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACVR2AP27037 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACVR2AP27037 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACVR2AP27037 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACVR2AP27037 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACVR2AP27037 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACVR2AP27037 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR2AP27037 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR2AP27037 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACVR2AP27037 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ACVR2AP27037 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACVR2AP27037 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ACVR2AP27037 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACVR2AP27037 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACVR2AP27037 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACVR2AP27037 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACVR2AP27037 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACVR2AP27037 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACVR2AP27037 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACVR2AP27037 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACVR2AP27037 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms