Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR4A1P22736 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR4A1P22736 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR4A1P22736 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR4A1P22736 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NR4A1P22736 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR4A1P22736 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NR4A1P22736 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR4A1P22736 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR4A1P22736 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR4A1P22736 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR4A1P22736 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR4A1P22736 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR4A1P22736 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR4A1P22736 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR4A1P22736 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR4A1P22736 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR4A1P22736 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR4A1P22736 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR4A1P22736 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR4A1P22736 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR4A1P22736 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR4A1P22736 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NR4A1P22736 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR4A1P22736 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NR4A1P22736 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR4A1P22736 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR4A1P22736 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR4A1P22736 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR4A1P22736 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR4A1P22736 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR4A1P22736 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR4A1P22736 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR4A1P22736 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR4A1P22736 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR4A1P22736 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR4A1P22736 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR4A1P22736 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR4A1P22736 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR4A1P22736 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR4A1P22736 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR4A1P22736 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR4A1P22736 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR4A1P22736 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR4A1P22736 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR4A1P22736 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR4A1P22736 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR4A1P22736 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR4A1P22736 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR4A1P22736 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR4A1P22736 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NR4A1P22736 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR4A1P22736 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR4A1P22736 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR4A1P22736 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR4A1P22736 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NR4A1P22736 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR4A1P22736 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR4A1P22736 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR4A1P22736 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR4A1P22736 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR4A1P22736 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR4A1P22736 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR4A1P22736 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR4A1P22736 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR4A1P22736 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR4A1P22736 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR4A1P22736 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR4A1P22736 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR4A1P22736 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR4A1P22736 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR4A1P22736 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR4A1P22736 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR4A1P22736 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR4A1P22736 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR4A1P22736 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR4A1P22736 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR4A1P22736 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR4A1P22736 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR4A1P22736 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR4A1P22736 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR4A1P22736 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms