Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCP2P22307 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCP2P22307 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCP2P22307 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCP2P22307 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCP2P22307 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCP2P22307 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCP2P22307 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCP2P22307 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCP2P22307 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCP2P22307 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCP2P22307 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCP2P22307 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCP2P22307 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCP2P22307 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCP2P22307 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SCP2P22307 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCP2P22307 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SCP2P22307 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCP2P22307 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCP2P22307 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCP2P22307 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCP2P22307 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCP2P22307 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCP2P22307 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCP2P22307 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCP2P22307 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCP2P22307 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCP2P22307 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCP2P22307 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCP2P22307 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCP2P22307 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCP2P22307 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCP2P22307 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCP2P22307 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCP2P22307 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCP2P22307 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCP2P22307 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCP2P22307 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCP2P22307 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCP2P22307 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SCP2P22307 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCP2P22307 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCP2P22307 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCP2P22307 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCP2P22307 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCP2P22307 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SCP2P22307 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCP2P22307 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCP2P22307 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCP2P22307 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCP2P22307 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCP2P22307 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCP2P22307 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCP2P22307 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCP2P22307 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCP2P22307 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCP2P22307 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCP2P22307 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCP2P22307 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCP2P22307 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCP2P22307 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SCP2P22307 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCP2P22307 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCP2P22307 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SCP2P22307 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCP2P22307 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCP2P22307 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCP2P22307 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCP2P22307 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCP2P22307 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCP2P22307 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SCP2P22307 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCP2P22307 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCP2P22307 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCP2P22307 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCP2P22307 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCP2P22307 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCP2P22307 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCP2P22307 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCP2P22307 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCP2P22307 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCP2P22307 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCP2P22307 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCP2P22307 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCP2P22307 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SCP2P22307 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCP2P22307 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCP2P22307 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCP2P22307 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCP2P22307 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCP2P22307 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCP2P22307 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCP2P22307 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCP2P22307 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SCP2P22307 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCP2P22307 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SCP2P22307 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SCP2P22307 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCP2P22307 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms