Protein–RNA interactions for Protein: P22105

TNXB, Tenascin-X, humanhuman

Predictions only

Length 4,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXBP22105 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNXBP22105 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNXBP22105 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNXBP22105 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNXBP22105 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNXBP22105 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNXBP22105 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXBP22105 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXBP22105 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNXBP22105 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNXBP22105 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNXBP22105 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXBP22105 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXBP22105 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXBP22105 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXBP22105 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXBP22105 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXBP22105 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXBP22105 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXBP22105 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXBP22105 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXBP22105 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXBP22105 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXBP22105 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXBP22105 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXBP22105 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXBP22105 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXBP22105 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXBP22105 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXBP22105 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXBP22105 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXBP22105 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXBP22105 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXBP22105 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXBP22105 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXBP22105 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNXBP22105 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXBP22105 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNXBP22105 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXBP22105 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXBP22105 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXBP22105 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNXBP22105 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNXBP22105 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNXBP22105 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNXBP22105 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXBP22105 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXBP22105 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXBP22105 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXBP22105 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXBP22105 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXBP22105 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXBP22105 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXBP22105 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNXBP22105 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXBP22105 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXBP22105 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXBP22105 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNXBP22105 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXBP22105 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNXBP22105 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNXBP22105 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXBP22105 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXBP22105 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXBP22105 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXBP22105 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNXBP22105 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXBP22105 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXBP22105 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXBP22105 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXBP22105 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXBP22105 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXBP22105 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXBP22105 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXBP22105 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXBP22105 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXBP22105 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXBP22105 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXBP22105 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXBP22105 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXBP22105 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXBP22105 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXBP22105 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXBP22105 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNXBP22105 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXBP22105 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNXBP22105 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXBP22105 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXBP22105 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXBP22105 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNXBP22105 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXBP22105 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXBP22105 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXBP22105 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNXBP22105 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXBP22105 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXBP22105 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNXBP22105 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXBP22105 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNXBP22105 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms