Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CD9P21926 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD9P21926 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD9P21926 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD9P21926 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CD9P21926 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD9P21926 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CD9P21926 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD9P21926 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD9P21926 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD9P21926 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD9P21926 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD9P21926 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD9P21926 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD9P21926 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD9P21926 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD9P21926 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD9P21926 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD9P21926 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD9P21926 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD9P21926 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD9P21926 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD9P21926 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD9P21926 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CD9P21926 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD9P21926 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD9P21926 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD9P21926 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD9P21926 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD9P21926 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD9P21926 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD9P21926 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD9P21926 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD9P21926 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD9P21926 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD9P21926 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD9P21926 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD9P21926 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD9P21926 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD9P21926 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD9P21926 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CD9P21926 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD9P21926 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD9P21926 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD9P21926 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CD9P21926 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD9P21926 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD9P21926 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD9P21926 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD9P21926 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD9P21926 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD9P21926 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD9P21926 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD9P21926 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD9P21926 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD9P21926 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD9P21926 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CD9P21926 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD9P21926 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD9P21926 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD9P21926 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD9P21926 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD9P21926 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD9P21926 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD9P21926 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD9P21926 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD9P21926 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD9P21926 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD9P21926 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD9P21926 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD9P21926 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD9P21926 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD9P21926 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD9P21926 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CD9P21926 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD9P21926 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD9P21926 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD9P21926 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD9P21926 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD9P21926 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD9P21926 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD9P21926 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD9P21926 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CD9P21926 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD9P21926 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD9P21926 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD9P21926 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD9P21926 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD9P21926 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CD9P21926 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CD9P21926 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD9P21926 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD9P21926 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD9P21926 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CD9P21926 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CD9P21926 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CD9P21926 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CD9P21926 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CD9P21926 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD9P21926 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms