Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCB4P21439 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCB4P21439 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCB4P21439 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCB4P21439 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCB4P21439 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ABCB4P21439 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ABCB4P21439 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ABCB4P21439 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCB4P21439 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCB4P21439 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCB4P21439 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCB4P21439 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCB4P21439 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCB4P21439 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCB4P21439 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCB4P21439 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ABCB4P21439 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCB4P21439 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCB4P21439 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCB4P21439 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCB4P21439 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCB4P21439 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCB4P21439 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCB4P21439 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCB4P21439 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCB4P21439 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCB4P21439 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCB4P21439 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCB4P21439 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCB4P21439 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCB4P21439 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCB4P21439 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCB4P21439 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCB4P21439 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCB4P21439 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCB4P21439 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCB4P21439 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB4P21439 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB4P21439 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCB4P21439 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCB4P21439 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCB4P21439 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCB4P21439 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCB4P21439 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCB4P21439 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCB4P21439 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCB4P21439 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCB4P21439 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCB4P21439 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCB4P21439 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB4P21439 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB4P21439 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB4P21439 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB4P21439 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCB4P21439 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCB4P21439 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCB4P21439 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCB4P21439 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCB4P21439 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCB4P21439 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCB4P21439 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCB4P21439 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCB4P21439 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCB4P21439 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCB4P21439 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCB4P21439 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCB4P21439 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCB4P21439 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCB4P21439 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCB4P21439 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCB4P21439 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCB4P21439 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCB4P21439 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCB4P21439 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCB4P21439 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCB4P21439 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCB4P21439 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCB4P21439 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCB4P21439 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCB4P21439 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCB4P21439 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCB4P21439 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCB4P21439 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCB4P21439 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCB4P21439 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCB4P21439 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCB4P21439 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.1 ms