Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE6GP18545 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE6GP18545 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE6GP18545 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE6GP18545 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6GP18545 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6GP18545 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6GP18545 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE6GP18545 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE6GP18545 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE6GP18545 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE6GP18545 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE6GP18545 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE6GP18545 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE6GP18545 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE6GP18545 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PDE6GP18545 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6GP18545 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6GP18545 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6GP18545 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6GP18545 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6GP18545 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE6GP18545 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE6GP18545 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6GP18545 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6GP18545 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6GP18545 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE6GP18545 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE6GP18545 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE6GP18545 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms