Protein–RNA interactions for Protein: P15822

HIVEP1, Zinc finger protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 2,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1P15822 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HIVEP1P15822 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HIVEP1P15822 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIVEP1P15822 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIVEP1P15822 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIVEP1P15822 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIVEP1P15822 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIVEP1P15822 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIVEP1P15822 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HIVEP1P15822 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIVEP1P15822 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HIVEP1P15822 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIVEP1P15822 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HIVEP1P15822 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIVEP1P15822 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HIVEP1P15822 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIVEP1P15822 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIVEP1P15822 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIVEP1P15822 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIVEP1P15822 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIVEP1P15822 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIVEP1P15822 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIVEP1P15822 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIVEP1P15822 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIVEP1P15822 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIVEP1P15822 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIVEP1P15822 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIVEP1P15822 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIVEP1P15822 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIVEP1P15822 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIVEP1P15822 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIVEP1P15822 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HIVEP1P15822 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIVEP1P15822 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIVEP1P15822 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIVEP1P15822 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIVEP1P15822 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIVEP1P15822 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIVEP1P15822 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIVEP1P15822 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIVEP1P15822 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIVEP1P15822 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HIVEP1P15822 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIVEP1P15822 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIVEP1P15822 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIVEP1P15822 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIVEP1P15822 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIVEP1P15822 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIVEP1P15822 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP1P15822 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP1P15822 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP1P15822 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIVEP1P15822 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIVEP1P15822 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIVEP1P15822 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIVEP1P15822 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIVEP1P15822 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIVEP1P15822 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIVEP1P15822 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIVEP1P15822 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIVEP1P15822 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIVEP1P15822 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1P15822 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1P15822 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIVEP1P15822 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIVEP1P15822 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIVEP1P15822 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIVEP1P15822 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HIVEP1P15822 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HIVEP1P15822 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1P15822 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1P15822 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIVEP1P15822 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIVEP1P15822 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIVEP1P15822 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIVEP1P15822 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIVEP1P15822 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIVEP1P15822 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIVEP1P15822 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIVEP1P15822 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIVEP1P15822 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIVEP1P15822 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIVEP1P15822 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIVEP1P15822 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIVEP1P15822 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIVEP1P15822 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIVEP1P15822 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIVEP1P15822 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms