Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SRFP11831 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRFP11831 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRFP11831 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SRFP11831 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRFP11831 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRFP11831 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRFP11831 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRFP11831 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRFP11831 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRFP11831 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRFP11831 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRFP11831 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRFP11831 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRFP11831 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SRFP11831 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRFP11831 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRFP11831 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRFP11831 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRFP11831 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRFP11831 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SRFP11831 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SRFP11831 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRFP11831 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRFP11831 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRFP11831 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRFP11831 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRFP11831 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRFP11831 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRFP11831 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRFP11831 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRFP11831 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRFP11831 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRFP11831 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SRFP11831 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRFP11831 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRFP11831 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRFP11831 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRFP11831 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SRFP11831 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRFP11831 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRFP11831 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRFP11831 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRFP11831 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SRFP11831 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRFP11831 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SRFP11831 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRFP11831 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRFP11831 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRFP11831 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRFP11831 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SRFP11831 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRFP11831 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SRFP11831 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRFP11831 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRFP11831 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRFP11831 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRFP11831 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRFP11831 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRFP11831 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRFP11831 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRFP11831 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRFP11831 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRFP11831 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRFP11831 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRFP11831 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRFP11831 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRFP11831 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRFP11831 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRFP11831 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRFP11831 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRFP11831 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRFP11831 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRFP11831 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRFP11831 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRFP11831 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRFP11831 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRFP11831 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRFP11831 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRFP11831 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRFP11831 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRFP11831 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRFP11831 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRFP11831 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SRFP11831 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRFP11831 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRFP11831 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRFP11831 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRFP11831 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRFP11831 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRFP11831 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRFP11831 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRFP11831 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRFP11831 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRFP11831 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRFP11831 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRFP11831 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRFP11831 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRFP11831 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRFP11831 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms