Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRM1P11229 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRM1P11229 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRM1P11229 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRM1P11229 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRM1P11229 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRM1P11229 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRM1P11229 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRM1P11229 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRM1P11229 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRM1P11229 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRM1P11229 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRM1P11229 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRM1P11229 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRM1P11229 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRM1P11229 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRM1P11229 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRM1P11229 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRM1P11229 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRM1P11229 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRM1P11229 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRM1P11229 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRM1P11229 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRM1P11229 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRM1P11229 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRM1P11229 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRM1P11229 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRM1P11229 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRM1P11229 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRM1P11229 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRM1P11229 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRM1P11229 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRM1P11229 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRM1P11229 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRM1P11229 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRM1P11229 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRM1P11229 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRM1P11229 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRM1P11229 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRM1P11229 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRM1P11229 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRM1P11229 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRM1P11229 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRM1P11229 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRM1P11229 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRM1P11229 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRM1P11229 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRM1P11229 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRM1P11229 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRM1P11229 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRM1P11229 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRM1P11229 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRM1P11229 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRM1P11229 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRM1P11229 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRM1P11229 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRM1P11229 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRM1P11229 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRM1P11229 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRM1P11229 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRM1P11229 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRM1P11229 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRM1P11229 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHRM1P11229 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHRM1P11229 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRM1P11229 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRM1P11229 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRM1P11229 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRM1P11229 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRM1P11229 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRM1P11229 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRM1P11229 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRM1P11229 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRM1P11229 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRM1P11229 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRM1P11229 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRM1P11229 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRM1P11229 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRM1P11229 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHRM1P11229 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRM1P11229 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRM1P11229 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRM1P11229 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRM1P11229 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRM1P11229 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRM1P11229 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRM1P11229 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRM1P11229 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms