Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPP1P10451 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPP1P10451 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPP1P10451 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPP1P10451 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPP1P10451 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPP1P10451 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPP1P10451 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPP1P10451 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPP1P10451 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPP1P10451 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPP1P10451 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPP1P10451 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPP1P10451 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPP1P10451 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPP1P10451 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPP1P10451 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPP1P10451 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPP1P10451 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPP1P10451 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPP1P10451 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPP1P10451 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPP1P10451 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPP1P10451 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPP1P10451 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPP1P10451 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPP1P10451 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPP1P10451 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPP1P10451 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPP1P10451 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPP1P10451 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPP1P10451 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPP1P10451 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPP1P10451 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPP1P10451 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPP1P10451 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPP1P10451 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPP1P10451 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPP1P10451 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPP1P10451 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPP1P10451 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPP1P10451 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPP1P10451 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPP1P10451 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPP1P10451 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPP1P10451 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPP1P10451 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPP1P10451 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPP1P10451 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPP1P10451 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPP1P10451 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPP1P10451 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPP1P10451 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPP1P10451 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPP1P10451 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPP1P10451 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPP1P10451 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPP1P10451 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPP1P10451 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPP1P10451 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPP1P10451 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPP1P10451 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPP1P10451 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPP1P10451 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPP1P10451 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPP1P10451 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPP1P10451 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPP1P10451 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPP1P10451 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPP1P10451 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPP1P10451 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPP1P10451 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPP1P10451 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPP1P10451 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPP1P10451 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPP1P10451 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPP1P10451 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPP1P10451 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPP1P10451 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPP1P10451 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPP1P10451 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPP1P10451 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPP1P10451 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPP1P10451 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPP1P10451 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPP1P10451 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPP1P10451 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPP1P10451 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPP1P10451 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPP1P10451 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPP1P10451 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPP1P10451 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPP1P10451 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPP1P10451 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPP1P10451 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPP1P10451 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPP1P10451 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPP1P10451 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPP1P10451 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPP1P10451 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms