Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MGPP08493 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MGPP08493 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MGPP08493 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MGPP08493 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGPP08493 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MGPP08493 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MGPP08493 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MGPP08493 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MGPP08493 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MGPP08493 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MGPP08493 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MGPP08493 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MGPP08493 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MGPP08493 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MGPP08493 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MGPP08493 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MGPP08493 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MGPP08493 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MGPP08493 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MGPP08493 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MGPP08493 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MGPP08493 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MGPP08493 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MGPP08493 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MGPP08493 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MGPP08493 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MGPP08493 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MGPP08493 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MGPP08493 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MGPP08493 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MGPP08493 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGPP08493 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGPP08493 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGPP08493 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGPP08493 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGPP08493 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGPP08493 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGPP08493 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGPP08493 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGPP08493 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGPP08493 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGPP08493 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGPP08493 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGPP08493 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGPP08493 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGPP08493 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGPP08493 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MGPP08493 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MGPP08493 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MGPP08493 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MGPP08493 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MGPP08493 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MGPP08493 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MGPP08493 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MGPP08493 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MGPP08493 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MGPP08493 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MGPP08493 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MGPP08493 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MGPP08493 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MGPP08493 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MGPP08493 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MGPP08493 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MGPP08493 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MGPP08493 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MGPP08493 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MGPP08493 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MGPP08493 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MGPP08493 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MGPP08493 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MGPP08493 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MGPP08493 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MGPP08493 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MGPP08493 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MGPP08493 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MGPP08493 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MGPP08493 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MGPP08493 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MGPP08493 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MGPP08493 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MGPP08493 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MGPP08493 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MGPP08493 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MGPP08493 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MGPP08493 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MGPP08493 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MGPP08493 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MGPP08493 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MGPP08493 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MGPP08493 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MGPP08493 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MGPP08493 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MGPP08493 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MGPP08493 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MGPP08493 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MGPP08493 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MGPP08493 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MGPP08493 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MGPP08493 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms