Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCKP06239 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCKP06239 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LCKP06239 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LCKP06239 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LCKP06239 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCKP06239 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCKP06239 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCKP06239 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCKP06239 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCKP06239 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCKP06239 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCKP06239 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LCKP06239 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCKP06239 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCKP06239 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCKP06239 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCKP06239 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCKP06239 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCKP06239 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCKP06239 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCKP06239 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCKP06239 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCKP06239 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCKP06239 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCKP06239 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCKP06239 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCKP06239 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCKP06239 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCKP06239 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCKP06239 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCKP06239 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LCKP06239 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCKP06239 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCKP06239 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCKP06239 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCKP06239 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCKP06239 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCKP06239 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCKP06239 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCKP06239 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCKP06239 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCKP06239 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCKP06239 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCKP06239 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCKP06239 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCKP06239 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCKP06239 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCKP06239 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCKP06239 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCKP06239 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCKP06239 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCKP06239 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCKP06239 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCKP06239 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCKP06239 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCKP06239 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCKP06239 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCKP06239 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCKP06239 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCKP06239 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCKP06239 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCKP06239 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LCKP06239 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCKP06239 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCKP06239 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCKP06239 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCKP06239 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCKP06239 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCKP06239 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCKP06239 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCKP06239 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCKP06239 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCKP06239 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCKP06239 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LCKP06239 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCKP06239 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCKP06239 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LCKP06239 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCKP06239 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LCKP06239 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCKP06239 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCKP06239 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCKP06239 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCKP06239 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCKP06239 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCKP06239 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCKP06239 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCKP06239 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCKP06239 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LCKP06239 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCKP06239 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LCKP06239 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCKP06239 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCKP06239 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCKP06239 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCKP06239 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCKP06239 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCKP06239 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCKP06239 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms