Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPLP1P05386 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPLP1P05386 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPLP1P05386 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPLP1P05386 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPLP1P05386 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPLP1P05386 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPLP1P05386 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPLP1P05386 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPLP1P05386 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPLP1P05386 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPLP1P05386 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPLP1P05386 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPLP1P05386 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPLP1P05386 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPLP1P05386 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPLP1P05386 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPLP1P05386 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPLP1P05386 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPLP1P05386 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPLP1P05386 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPLP1P05386 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPLP1P05386 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPLP1P05386 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPLP1P05386 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPLP1P05386 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPLP1P05386 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPLP1P05386 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPLP1P05386 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPLP1P05386 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPLP1P05386 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPLP1P05386 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPLP1P05386 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPLP1P05386 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPLP1P05386 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPLP1P05386 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPLP1P05386 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPLP1P05386 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPLP1P05386 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPLP1P05386 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPLP1P05386 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPLP1P05386 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPLP1P05386 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPLP1P05386 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPLP1P05386 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPLP1P05386 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms