Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TK1P04183 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK1P04183 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK1P04183 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TK1P04183 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TK1P04183 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TK1P04183 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TK1P04183 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TK1P04183 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TK1P04183 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TK1P04183 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TK1P04183 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TK1P04183 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK1P04183 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK1P04183 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK1P04183 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK1P04183 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK1P04183 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TK1P04183 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TK1P04183 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TK1P04183 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TK1P04183 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TK1P04183 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TK1P04183 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TK1P04183 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TK1P04183 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TK1P04183 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TK1P04183 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TK1P04183 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TK1P04183 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TK1P04183 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TK1P04183 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TK1P04183 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TK1P04183 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TK1P04183 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TK1P04183 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TK1P04183 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TK1P04183 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TK1P04183 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TK1P04183 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TK1P04183 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TK1P04183 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TK1P04183 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TK1P04183 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TK1P04183 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TK1P04183 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TK1P04183 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TK1P04183 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TK1P04183 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TK1P04183 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TK1P04183 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TK1P04183 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TK1P04183 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TK1P04183 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TK1P04183 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TK1P04183 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TK1P04183 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TK1P04183 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TK1P04183 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TK1P04183 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TK1P04183 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TK1P04183 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TK1P04183 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TK1P04183 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TK1P04183 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TK1P04183 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TK1P04183 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TK1P04183 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TK1P04183 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TK1P04183 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TK1P04183 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TK1P04183 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TK1P04183 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TK1P04183 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TK1P04183 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TK1P04183 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TK1P04183 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TK1P04183 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TK1P04183 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TK1P04183 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TK1P04183 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TK1P04183 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TK1P04183 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TK1P04183 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TK1P04183 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TK1P04183 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TK1P04183 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TK1P04183 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TK1P04183 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TK1P04183 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TK1P04183 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TK1P04183 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TK1P04183 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TK1P04183 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TK1P04183 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TK1P04183 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TK1P04183 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TK1P04183 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TK1P04183 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TK1P04183 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms