Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SEC24BO95487 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SEC24BO95487 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SEC24BO95487 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SEC24BO95487 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SEC24BO95487 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SEC24BO95487 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SEC24BO95487 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SEC24BO95487 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SEC24BO95487 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SEC24BO95487 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SEC24BO95487 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SEC24BO95487 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SEC24BO95487 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SEC24BO95487 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SEC24BO95487 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SEC24BO95487 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SEC24BO95487 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SEC24BO95487 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SEC24BO95487 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SEC24BO95487 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SEC24BO95487 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SEC24BO95487 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SEC24BO95487 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SEC24BO95487 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SEC24BO95487 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SEC24BO95487 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SEC24BO95487 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SEC24BO95487 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SEC24BO95487 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SEC24BO95487 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SEC24BO95487 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SEC24BO95487 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SEC24BO95487 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SEC24BO95487 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SEC24BO95487 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SEC24BO95487 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SEC24BO95487 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SEC24BO95487 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SEC24BO95487 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SEC24BO95487 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SEC24BO95487 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SEC24BO95487 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SEC24BO95487 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SEC24BO95487 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SEC24BO95487 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SEC24BO95487 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SEC24BO95487 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SEC24BO95487 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SEC24BO95487 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SEC24BO95487 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SEC24BO95487 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SEC24BO95487 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SEC24BO95487 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SEC24BO95487 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SEC24BO95487 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SEC24BO95487 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SEC24BO95487 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SEC24BO95487 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SEC24BO95487 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SEC24BO95487 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SEC24BO95487 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SEC24BO95487 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SEC24BO95487 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SEC24BO95487 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SEC24BO95487 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SEC24BO95487 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SEC24BO95487 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SEC24BO95487 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SEC24BO95487 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SEC24BO95487 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SEC24BO95487 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SEC24BO95487 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SEC24BO95487 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SEC24BO95487 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SEC24BO95487 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SEC24BO95487 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SEC24BO95487 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SEC24BO95487 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SEC24BO95487 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SEC24BO95487 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SEC24BO95487 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SEC24BO95487 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SEC24BO95487 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SEC24BO95487 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SEC24BO95487 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SEC24BO95487 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SEC24BO95487 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SEC24BO95487 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SEC24BO95487 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SEC24BO95487 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SEC24BO95487 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SEC24BO95487 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SEC24BO95487 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SEC24BO95487 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SEC24BO95487 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SEC24BO95487 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SEC24BO95487 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SEC24BO95487 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SEC24BO95487 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms