Protein–RNA interactions for Protein: O95264

HTR3B, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3BO95264 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR3BO95264 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR3BO95264 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR3BO95264 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR3BO95264 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR3BO95264 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR3BO95264 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR3BO95264 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR3BO95264 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR3BO95264 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR3BO95264 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR3BO95264 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR3BO95264 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR3BO95264 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR3BO95264 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR3BO95264 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR3BO95264 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR3BO95264 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR3BO95264 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR3BO95264 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTR3BO95264 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTR3BO95264 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTR3BO95264 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR3BO95264 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HTR3BO95264 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR3BO95264 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR3BO95264 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR3BO95264 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR3BO95264 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR3BO95264 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR3BO95264 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR3BO95264 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR3BO95264 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR3BO95264 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR3BO95264 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR3BO95264 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR3BO95264 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR3BO95264 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR3BO95264 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR3BO95264 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR3BO95264 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR3BO95264 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTR3BO95264 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR3BO95264 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR3BO95264 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR3BO95264 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR3BO95264 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR3BO95264 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR3BO95264 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR3BO95264 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR3BO95264 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR3BO95264 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR3BO95264 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTR3BO95264 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR3BO95264 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR3BO95264 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR3BO95264 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR3BO95264 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR3BO95264 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTR3BO95264 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR3BO95264 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR3BO95264 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR3BO95264 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR3BO95264 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR3BO95264 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR3BO95264 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR3BO95264 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR3BO95264 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms