Protein–RNA interactions for Protein: O95264

HTR3B, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3BO95264 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTR3BO95264 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HTR3BO95264 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HTR3BO95264 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTR3BO95264 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HTR3BO95264 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTR3BO95264 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTR3BO95264 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTR3BO95264 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTR3BO95264 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTR3BO95264 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTR3BO95264 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTR3BO95264 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTR3BO95264 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTR3BO95264 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTR3BO95264 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HTR3BO95264 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HTR3BO95264 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTR3BO95264 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTR3BO95264 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTR3BO95264 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTR3BO95264 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR3BO95264 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTR3BO95264 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTR3BO95264 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR3BO95264 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR3BO95264 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR3BO95264 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTR3BO95264 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTR3BO95264 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTR3BO95264 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR3BO95264 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTR3BO95264 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTR3BO95264 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTR3BO95264 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTR3BO95264 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTR3BO95264 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR3BO95264 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTR3BO95264 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTR3BO95264 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTR3BO95264 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTR3BO95264 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTR3BO95264 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTR3BO95264 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR3BO95264 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTR3BO95264 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR3BO95264 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTR3BO95264 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTR3BO95264 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTR3BO95264 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTR3BO95264 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTR3BO95264 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTR3BO95264 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTR3BO95264 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTR3BO95264 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTR3BO95264 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTR3BO95264 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR3BO95264 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR3BO95264 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR3BO95264 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR3BO95264 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR3BO95264 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR3BO95264 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR3BO95264 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTR3BO95264 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTR3BO95264 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR3BO95264 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR3BO95264 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR3BO95264 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR3BO95264 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR3BO95264 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTR3BO95264 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR3BO95264 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR3BO95264 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR3BO95264 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR3BO95264 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR3BO95264 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR3BO95264 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR3BO95264 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR3BO95264 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR3BO95264 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR3BO95264 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR3BO95264 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR3BO95264 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR3BO95264 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HTR3BO95264 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HTR3BO95264 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR3BO95264 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR3BO95264 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR3BO95264 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTR3BO95264 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR3BO95264 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR3BO95264 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR3BO95264 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR3BO95264 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR3BO95264 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTR3BO95264 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTR3BO95264 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTR3BO95264 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTR3BO95264 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms