Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBL3O95164 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBL3O95164 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBL3O95164 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBL3O95164 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBL3O95164 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBL3O95164 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBL3O95164 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBL3O95164 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBL3O95164 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBL3O95164 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBL3O95164 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBL3O95164 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBL3O95164 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBL3O95164 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBL3O95164 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBL3O95164 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBL3O95164 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBL3O95164 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBL3O95164 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBL3O95164 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBL3O95164 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBL3O95164 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBL3O95164 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBL3O95164 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBL3O95164 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBL3O95164 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBL3O95164 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBL3O95164 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBL3O95164 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBL3O95164 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBL3O95164 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBL3O95164 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBL3O95164 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBL3O95164 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBL3O95164 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBL3O95164 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBL3O95164 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBL3O95164 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBL3O95164 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBL3O95164 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBL3O95164 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBL3O95164 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBL3O95164 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBL3O95164 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBL3O95164 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL3O95164 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL3O95164 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL3O95164 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL3O95164 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL3O95164 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL3O95164 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBL3O95164 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBL3O95164 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBL3O95164 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL3O95164 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL3O95164 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL3O95164 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL3O95164 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL3O95164 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL3O95164 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBL3O95164 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBL3O95164 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBL3O95164 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBL3O95164 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL3O95164 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL3O95164 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL3O95164 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBL3O95164 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL3O95164 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL3O95164 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL3O95164 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL3O95164 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBL3O95164 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBL3O95164 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBL3O95164 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBL3O95164 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL3O95164 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL3O95164 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL3O95164 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBL3O95164 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBL3O95164 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL3O95164 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL3O95164 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL3O95164 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBL3O95164 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBL3O95164 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBL3O95164 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBL3O95164 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBL3O95164 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBL3O95164 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBL3O95164 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBL3O95164 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBL3O95164 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBL3O95164 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBL3O95164 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBL3O95164 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBL3O95164 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBL3O95164 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBL3O95164 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms