Protein–RNA interactions for Protein: O94844

RHOBTB1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB1O94844 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RHOBTB1O94844 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RHOBTB1O94844 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RHOBTB1O94844 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RHOBTB1O94844 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RHOBTB1O94844 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RHOBTB1O94844 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RHOBTB1O94844 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RHOBTB1O94844 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RHOBTB1O94844 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RHOBTB1O94844 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RHOBTB1O94844 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RHOBTB1O94844 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RHOBTB1O94844 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RHOBTB1O94844 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RHOBTB1O94844 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RHOBTB1O94844 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RHOBTB1O94844 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RHOBTB1O94844 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RHOBTB1O94844 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RHOBTB1O94844 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RHOBTB1O94844 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RHOBTB1O94844 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RHOBTB1O94844 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RHOBTB1O94844 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RHOBTB1O94844 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RHOBTB1O94844 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOBTB1O94844 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOBTB1O94844 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RHOBTB1O94844 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RHOBTB1O94844 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHOBTB1O94844 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RHOBTB1O94844 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RHOBTB1O94844 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RHOBTB1O94844 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RHOBTB1O94844 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RHOBTB1O94844 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RHOBTB1O94844 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RHOBTB1O94844 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RHOBTB1O94844 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOBTB1O94844 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RHOBTB1O94844 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RHOBTB1O94844 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHOBTB1O94844 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RHOBTB1O94844 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RHOBTB1O94844 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RHOBTB1O94844 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RHOBTB1O94844 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RHOBTB1O94844 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RHOBTB1O94844 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RHOBTB1O94844 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOBTB1O94844 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHOBTB1O94844 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHOBTB1O94844 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHOBTB1O94844 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RHOBTB1O94844 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RHOBTB1O94844 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RHOBTB1O94844 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHOBTB1O94844 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RHOBTB1O94844 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RHOBTB1O94844 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB1O94844 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOBTB1O94844 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOBTB1O94844 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOBTB1O94844 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOBTB1O94844 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOBTB1O94844 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RHOBTB1O94844 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RHOBTB1O94844 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHOBTB1O94844 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOBTB1O94844 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB1O94844 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB1O94844 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOBTB1O94844 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHOBTB1O94844 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.8 ms