Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
EIF3JO75822 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
EIF3JO75822 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EIF3JO75822 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EIF3JO75822 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EIF3JO75822 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EIF3JO75822 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
EIF3JO75822 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EIF3JO75822 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
EIF3JO75822 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
EIF3JO75822 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
EIF3JO75822 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
EIF3JO75822 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3JO75822 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3JO75822 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EIF3JO75822 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EIF3JO75822 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EIF3JO75822 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EIF3JO75822 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
EIF3JO75822 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EIF3JO75822 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
EIF3JO75822 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EIF3JO75822 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
EIF3JO75822 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EIF3JO75822 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EIF3JO75822 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EIF3JO75822 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
EIF3JO75822 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EIF3JO75822 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EIF3JO75822 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EIF3JO75822 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EIF3JO75822 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EIF3JO75822 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
EIF3JO75822 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
EIF3JO75822 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
EIF3JO75822 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
EIF3JO75822 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
EIF3JO75822 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
EIF3JO75822 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
EIF3JO75822 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
EIF3JO75822 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
EIF3JO75822 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
EIF3JO75822 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
EIF3JO75822 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3JO75822 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3JO75822 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
EIF3JO75822 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
EIF3JO75822 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EIF3JO75822 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EIF3JO75822 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EIF3JO75822 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
EIF3JO75822 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EIF3JO75822 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EIF3JO75822 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EIF3JO75822 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EIF3JO75822 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EIF3JO75822 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EIF3JO75822 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EIF3JO75822 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EIF3JO75822 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
EIF3JO75822 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
EIF3JO75822 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EIF3JO75822 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EIF3JO75822 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EIF3JO75822 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
EIF3JO75822 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EIF3JO75822 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EIF3JO75822 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
EIF3JO75822 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
EIF3JO75822 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
EIF3JO75822 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EIF3JO75822 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
EIF3JO75822 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
EIF3JO75822 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
EIF3JO75822 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
EIF3JO75822 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EIF3JO75822 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EIF3JO75822 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
EIF3JO75822 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
EIF3JO75822 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
EIF3JO75822 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
EIF3JO75822 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
EIF3JO75822 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
EIF3JO75822 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
EIF3JO75822 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
EIF3JO75822 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
EIF3JO75822 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
EIF3JO75822 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
EIF3JO75822 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
EIF3JO75822 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
EIF3JO75822 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
EIF3JO75822 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
EIF3JO75822 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms