Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F6O75461 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F6O75461 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F6O75461 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F6O75461 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F6O75461 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F6O75461 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
E2F6O75461 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E2F6O75461 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E2F6O75461 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F6O75461 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F6O75461 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
E2F6O75461 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
E2F6O75461 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F6O75461 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F6O75461 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F6O75461 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F6O75461 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F6O75461 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F6O75461 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F6O75461 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
E2F6O75461 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F6O75461 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F6O75461 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F6O75461 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F6O75461 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F6O75461 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F6O75461 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F6O75461 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F6O75461 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F6O75461 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F6O75461 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F6O75461 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F6O75461 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F6O75461 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F6O75461 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F6O75461 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F6O75461 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F6O75461 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F6O75461 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F6O75461 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F6O75461 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F6O75461 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F6O75461 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F6O75461 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F6O75461 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F6O75461 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F6O75461 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F6O75461 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F6O75461 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F6O75461 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F6O75461 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F6O75461 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F6O75461 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F6O75461 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F6O75461 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F6O75461 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
E2F6O75461 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
E2F6O75461 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F6O75461 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F6O75461 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F6O75461 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F6O75461 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F6O75461 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F6O75461 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F6O75461 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F6O75461 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F6O75461 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F6O75461 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F6O75461 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F6O75461 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F6O75461 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
E2F6O75461 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F6O75461 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F6O75461 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F6O75461 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F6O75461 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F6O75461 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F6O75461 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F6O75461 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F6O75461 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F6O75461 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F6O75461 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F6O75461 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F6O75461 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F6O75461 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F6O75461 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F6O75461 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F6O75461 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F6O75461 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F6O75461 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F6O75461 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F6O75461 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F6O75461 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F6O75461 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F6O75461 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F6O75461 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F6O75461 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F6O75461 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
E2F6O75461 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms