Protein–RNA interactions for Protein: O60925

PFDN1, Prefoldin subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN1O60925 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFDN1O60925 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFDN1O60925 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN1O60925 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFDN1O60925 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFDN1O60925 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFDN1O60925 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFDN1O60925 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFDN1O60925 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFDN1O60925 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PFDN1O60925 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFDN1O60925 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFDN1O60925 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN1O60925 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN1O60925 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN1O60925 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN1O60925 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFDN1O60925 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFDN1O60925 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFDN1O60925 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFDN1O60925 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFDN1O60925 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFDN1O60925 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFDN1O60925 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFDN1O60925 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFDN1O60925 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFDN1O60925 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFDN1O60925 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFDN1O60925 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFDN1O60925 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFDN1O60925 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFDN1O60925 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFDN1O60925 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFDN1O60925 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFDN1O60925 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFDN1O60925 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFDN1O60925 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFDN1O60925 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFDN1O60925 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFDN1O60925 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFDN1O60925 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFDN1O60925 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PFDN1O60925 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFDN1O60925 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFDN1O60925 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFDN1O60925 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFDN1O60925 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PFDN1O60925 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFDN1O60925 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PFDN1O60925 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PFDN1O60925 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PFDN1O60925 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PFDN1O60925 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN1O60925 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN1O60925 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN1O60925 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PFDN1O60925 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PFDN1O60925 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN1O60925 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN1O60925 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN1O60925 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PFDN1O60925 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFDN1O60925 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFDN1O60925 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFDN1O60925 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFDN1O60925 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFDN1O60925 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PFDN1O60925 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFDN1O60925 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFDN1O60925 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFDN1O60925 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFDN1O60925 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFDN1O60925 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFDN1O60925 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFDN1O60925 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN1O60925 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFDN1O60925 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFDN1O60925 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFDN1O60925 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFDN1O60925 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFDN1O60925 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFDN1O60925 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFDN1O60925 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFDN1O60925 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFDN1O60925 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFDN1O60925 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFDN1O60925 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFDN1O60925 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN1O60925 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms