Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GFRA3O60609 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GFRA3O60609 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GFRA3O60609 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GFRA3O60609 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GFRA3O60609 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GFRA3O60609 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GFRA3O60609 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GFRA3O60609 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GFRA3O60609 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GFRA3O60609 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GFRA3O60609 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GFRA3O60609 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GFRA3O60609 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GFRA3O60609 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GFRA3O60609 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GFRA3O60609 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GFRA3O60609 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GFRA3O60609 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GFRA3O60609 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GFRA3O60609 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GFRA3O60609 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GFRA3O60609 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GFRA3O60609 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GFRA3O60609 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GFRA3O60609 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GFRA3O60609 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GFRA3O60609 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GFRA3O60609 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GFRA3O60609 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GFRA3O60609 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GFRA3O60609 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GFRA3O60609 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GFRA3O60609 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GFRA3O60609 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GFRA3O60609 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GFRA3O60609 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GFRA3O60609 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GFRA3O60609 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GFRA3O60609 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GFRA3O60609 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GFRA3O60609 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GFRA3O60609 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GFRA3O60609 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GFRA3O60609 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GFRA3O60609 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GFRA3O60609 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GFRA3O60609 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GFRA3O60609 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GFRA3O60609 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GFRA3O60609 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GFRA3O60609 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GFRA3O60609 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GFRA3O60609 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GFRA3O60609 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GFRA3O60609 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GFRA3O60609 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GFRA3O60609 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GFRA3O60609 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GFRA3O60609 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GFRA3O60609 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GFRA3O60609 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GFRA3O60609 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GFRA3O60609 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GFRA3O60609 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GFRA3O60609 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GFRA3O60609 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GFRA3O60609 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GFRA3O60609 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GFRA3O60609 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GFRA3O60609 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GFRA3O60609 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GFRA3O60609 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GFRA3O60609 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GFRA3O60609 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GFRA3O60609 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GFRA3O60609 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GFRA3O60609 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GFRA3O60609 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GFRA3O60609 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GFRA3O60609 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GFRA3O60609 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GFRA3O60609 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GFRA3O60609 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GFRA3O60609 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GFRA3O60609 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GFRA3O60609 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GFRA3O60609 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GFRA3O60609 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GFRA3O60609 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GFRA3O60609 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms