Protein–RNA interactions for Protein: O60583

CCNT2, Cyclin-T2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT2O60583 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNT2O60583 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNT2O60583 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNT2O60583 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNT2O60583 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNT2O60583 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNT2O60583 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNT2O60583 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT2O60583 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT2O60583 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT2O60583 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT2O60583 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNT2O60583 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNT2O60583 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNT2O60583 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNT2O60583 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNT2O60583 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNT2O60583 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNT2O60583 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNT2O60583 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNT2O60583 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNT2O60583 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNT2O60583 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNT2O60583 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNT2O60583 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCNT2O60583 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNT2O60583 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCNT2O60583 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCNT2O60583 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNT2O60583 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNT2O60583 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNT2O60583 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNT2O60583 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNT2O60583 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNT2O60583 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNT2O60583 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNT2O60583 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNT2O60583 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNT2O60583 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNT2O60583 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNT2O60583 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNT2O60583 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNT2O60583 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNT2O60583 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNT2O60583 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNT2O60583 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNT2O60583 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNT2O60583 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNT2O60583 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNT2O60583 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNT2O60583 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNT2O60583 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNT2O60583 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNT2O60583 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNT2O60583 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNT2O60583 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNT2O60583 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNT2O60583 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNT2O60583 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNT2O60583 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNT2O60583 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNT2O60583 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNT2O60583 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT2O60583 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT2O60583 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT2O60583 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNT2O60583 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNT2O60583 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNT2O60583 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNT2O60583 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNT2O60583 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNT2O60583 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNT2O60583 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT2O60583 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT2O60583 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNT2O60583 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNT2O60583 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNT2O60583 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNT2O60583 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNT2O60583 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNT2O60583 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNT2O60583 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNT2O60583 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNT2O60583 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNT2O60583 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms