Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC7A4O43246 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC7A4O43246 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC7A4O43246 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC7A4O43246 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC7A4O43246 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC7A4O43246 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC7A4O43246 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC7A4O43246 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC7A4O43246 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC7A4O43246 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC7A4O43246 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC7A4O43246 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC7A4O43246 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC7A4O43246 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC7A4O43246 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A4O43246 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A4O43246 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC7A4O43246 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC7A4O43246 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC7A4O43246 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC7A4O43246 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC7A4O43246 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC7A4O43246 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC7A4O43246 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC7A4O43246 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC7A4O43246 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC7A4O43246 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC7A4O43246 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC7A4O43246 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC7A4O43246 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC7A4O43246 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLC7A4O43246 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC7A4O43246 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC7A4O43246 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC7A4O43246 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC7A4O43246 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC7A4O43246 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC7A4O43246 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC7A4O43246 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC7A4O43246 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC7A4O43246 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC7A4O43246 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC7A4O43246 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC7A4O43246 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC7A4O43246 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC7A4O43246 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC7A4O43246 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC7A4O43246 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC7A4O43246 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC7A4O43246 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC7A4O43246 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC7A4O43246 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC7A4O43246 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC7A4O43246 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC7A4O43246 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC7A4O43246 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC7A4O43246 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC7A4O43246 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC7A4O43246 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC7A4O43246 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms