Protein–RNA interactions for Protein: O15523

DDX3Y, ATP-dependent RNA helicase DDX3Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3YO15523 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX3YO15523 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
DDX3YO15523 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX3YO15523 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX3YO15523 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX3YO15523 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX3YO15523 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX3YO15523 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX3YO15523 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX3YO15523 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX3YO15523 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX3YO15523 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX3YO15523 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX3YO15523 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX3YO15523 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX3YO15523 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX3YO15523 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX3YO15523 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX3YO15523 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX3YO15523 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX3YO15523 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX3YO15523 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX3YO15523 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX3YO15523 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX3YO15523 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX3YO15523 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX3YO15523 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX3YO15523 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX3YO15523 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX3YO15523 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX3YO15523 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX3YO15523 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX3YO15523 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX3YO15523 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX3YO15523 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX3YO15523 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX3YO15523 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX3YO15523 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX3YO15523 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX3YO15523 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DDX3YO15523 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX3YO15523 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX3YO15523 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX3YO15523 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX3YO15523 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX3YO15523 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX3YO15523 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX3YO15523 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX3YO15523 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX3YO15523 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX3YO15523 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX3YO15523 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX3YO15523 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX3YO15523 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX3YO15523 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX3YO15523 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX3YO15523 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX3YO15523 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX3YO15523 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX3YO15523 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX3YO15523 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX3YO15523 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX3YO15523 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX3YO15523 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX3YO15523 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX3YO15523 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX3YO15523 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX3YO15523 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX3YO15523 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX3YO15523 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX3YO15523 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX3YO15523 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX3YO15523 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX3YO15523 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX3YO15523 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX3YO15523 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX3YO15523 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX3YO15523 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX3YO15523 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX3YO15523 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX3YO15523 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX3YO15523 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX3YO15523 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX3YO15523 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX3YO15523 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX3YO15523 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX3YO15523 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX3YO15523 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms