Protein–RNA interactions for Protein: O15397

IPO8, Importin-8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO8O15397 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
IPO8O15397 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
IPO8O15397 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
IPO8O15397 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
IPO8O15397 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
IPO8O15397 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
IPO8O15397 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
IPO8O15397 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
IPO8O15397 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
IPO8O15397 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
IPO8O15397 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
IPO8O15397 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
IPO8O15397 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
IPO8O15397 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
IPO8O15397 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
IPO8O15397 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
IPO8O15397 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
IPO8O15397 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
IPO8O15397 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
IPO8O15397 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
IPO8O15397 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
IPO8O15397 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
IPO8O15397 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
IPO8O15397 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
IPO8O15397 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
IPO8O15397 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
IPO8O15397 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IPO8O15397 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IPO8O15397 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IPO8O15397 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IPO8O15397 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
IPO8O15397 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
IPO8O15397 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
IPO8O15397 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
IPO8O15397 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
IPO8O15397 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
IPO8O15397 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
IPO8O15397 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
IPO8O15397 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
IPO8O15397 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
IPO8O15397 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
IPO8O15397 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IPO8O15397 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IPO8O15397 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IPO8O15397 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
IPO8O15397 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IPO8O15397 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IPO8O15397 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IPO8O15397 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IPO8O15397 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
IPO8O15397 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
IPO8O15397 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
IPO8O15397 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
IPO8O15397 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
IPO8O15397 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
IPO8O15397 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
IPO8O15397 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
IPO8O15397 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
IPO8O15397 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
IPO8O15397 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
IPO8O15397 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
IPO8O15397 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
IPO8O15397 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
IPO8O15397 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
IPO8O15397 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
IPO8O15397 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
IPO8O15397 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
IPO8O15397 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
IPO8O15397 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
IPO8O15397 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
IPO8O15397 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
IPO8O15397 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
IPO8O15397 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
IPO8O15397 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
IPO8O15397 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
IPO8O15397 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
IPO8O15397 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IPO8O15397 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IPO8O15397 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IPO8O15397 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IPO8O15397 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IPO8O15397 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
IPO8O15397 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IPO8O15397 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
IPO8O15397 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
IPO8O15397 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
IPO8O15397 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
IPO8O15397 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
IPO8O15397 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
IPO8O15397 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
IPO8O15397 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
IPO8O15397 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
IPO8O15397 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
IPO8O15397 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
IPO8O15397 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
IPO8O15397 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
IPO8O15397 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
IPO8O15397 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
IPO8O15397 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IPO8O15397 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 800.7 ms