Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCF2LO15068 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCF2LO15068 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCF2LO15068 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCF2LO15068 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCF2LO15068 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCF2LO15068 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCF2LO15068 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCF2LO15068 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCF2LO15068 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MCF2LO15068 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCF2LO15068 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCF2LO15068 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCF2LO15068 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCF2LO15068 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCF2LO15068 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCF2LO15068 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCF2LO15068 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCF2LO15068 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCF2LO15068 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCF2LO15068 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCF2LO15068 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCF2LO15068 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCF2LO15068 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCF2LO15068 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCF2LO15068 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MCF2LO15068 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCF2LO15068 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCF2LO15068 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCF2LO15068 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCF2LO15068 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MCF2LO15068 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCF2LO15068 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCF2LO15068 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCF2LO15068 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCF2LO15068 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCF2LO15068 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCF2LO15068 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCF2LO15068 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCF2LO15068 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCF2LO15068 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCF2LO15068 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCF2LO15068 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCF2LO15068 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCF2LO15068 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCF2LO15068 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCF2LO15068 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCF2LO15068 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCF2LO15068 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCF2LO15068 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCF2LO15068 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MCF2LO15068 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCF2LO15068 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCF2LO15068 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCF2LO15068 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCF2LO15068 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MCF2LO15068 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCF2LO15068 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCF2LO15068 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCF2LO15068 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms