Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4O14817 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN4O14817 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN4O14817 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN4O14817 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN4O14817 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN4O14817 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4O14817 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4O14817 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4O14817 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4O14817 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4O14817 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4O14817 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4O14817 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4O14817 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4O14817 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4O14817 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4O14817 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4O14817 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4O14817 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4O14817 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4O14817 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4O14817 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4O14817 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4O14817 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN4O14817 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN4O14817 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN4O14817 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN4O14817 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN4O14817 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN4O14817 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN4O14817 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4O14817 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4O14817 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4O14817 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4O14817 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN4O14817 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4O14817 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4O14817 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4O14817 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN4O14817 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN4O14817 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN4O14817 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN4O14817 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN4O14817 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN4O14817 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN4O14817 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN4O14817 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN4O14817 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN4O14817 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN4O14817 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN4O14817 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN4O14817 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN4O14817 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN4O14817 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN4O14817 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN4O14817 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN4O14817 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN4O14817 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSPAN4O14817 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms