Protein–RNA interactions for Protein: K9M1U5

IFNL4, Interferon lambda-4, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL4K9M1U5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNL4K9M1U5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNL4K9M1U5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL4K9M1U5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNL4K9M1U5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL4K9M1U5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNL4K9M1U5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNL4K9M1U5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNL4K9M1U5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNL4K9M1U5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNL4K9M1U5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNL4K9M1U5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNL4K9M1U5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNL4K9M1U5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNL4K9M1U5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFNL4K9M1U5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFNL4K9M1U5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFNL4K9M1U5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNL4K9M1U5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNL4K9M1U5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNL4K9M1U5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNL4K9M1U5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNL4K9M1U5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL4K9M1U5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNL4K9M1U5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL4K9M1U5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL4K9M1U5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNL4K9M1U5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNL4K9M1U5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL4K9M1U5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL4K9M1U5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL4K9M1U5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL4K9M1U5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL4K9M1U5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL4K9M1U5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL4K9M1U5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL4K9M1U5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL4K9M1U5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNL4K9M1U5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL4K9M1U5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL4K9M1U5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL4K9M1U5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL4K9M1U5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL4K9M1U5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL4K9M1U5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL4K9M1U5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL4K9M1U5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL4K9M1U5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNL4K9M1U5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL4K9M1U5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms