Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
J3QLW9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
J3QLW9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
J3QLW9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
J3QLW9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
J3QLW9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
J3QLW9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
J3QLW9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3QLW9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3QLW9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3QLW9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
J3QLW9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
J3QLW9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
J3QLW9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
J3QLW9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
J3QLW9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
J3QLW9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
J3QLW9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
J3QLW9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
J3QLW9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
J3QLW9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
J3QLW9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
J3QLW9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
J3QLW9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
J3QLW9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
J3QLW9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
J3QLW9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
J3QLW9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
J3QLW9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
J3QLW9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
J3QLW9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
J3QLW9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
J3QLW9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
J3QLW9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
J3QLW9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
J3QLW9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
J3QLW9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
J3QLW9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
J3QLW9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
J3QLW9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
J3QLW9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
J3QLW9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QLW9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QLW9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
J3QLW9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
J3QLW9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3QLW9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3QLW9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3QLW9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3QLW9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3QLW9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
J3QLW9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3QLW9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3QLW9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3QLW9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3QLW9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3QLW9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3QLW9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QLW9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QLW9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3QLW9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3QLW9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3QLW9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3QLW9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
J3QLW9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
J3QLW9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3QLW9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3QLW9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3QLW9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3QLW9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3QLW9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
J3QLW9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3QLW9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3QLW9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3QLW9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3QLW9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3QLW9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
J3QLW9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
J3QLW9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
J3QLW9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3QLW9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3QLW9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3QLW9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3QLW9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3QLW9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3QLW9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3QLW9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
J3QLW9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
J3QLW9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
J3QLW9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
J3QLW9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
J3QLW9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
J3QLW9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3QLW9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3QLW9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3QLW9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3QLW9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
J3QLW9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
J3QLW9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
J3QLW9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms