Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM25AB3EWG3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM25AB3EWG3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM25AB3EWG3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM25AB3EWG3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM25AB3EWG3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM25AB3EWG3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM25AB3EWG3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM25AB3EWG3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM25AB3EWG3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM25AB3EWG3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM25AB3EWG3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM25AB3EWG3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM25AB3EWG3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM25AB3EWG3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM25AB3EWG3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM25AB3EWG3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM25AB3EWG3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM25AB3EWG3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM25AB3EWG3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM25AB3EWG3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM25AB3EWG3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM25AB3EWG3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM25AB3EWG3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM25AB3EWG3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM25AB3EWG3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM25AB3EWG3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM25AB3EWG3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM25AB3EWG3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM25AB3EWG3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM25AB3EWG3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM25AB3EWG3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM25AB3EWG3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM25AB3EWG3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM25AB3EWG3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM25AB3EWG3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM25AB3EWG3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM25AB3EWG3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM25AB3EWG3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM25AB3EWG3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM25AB3EWG3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM25AB3EWG3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM25AB3EWG3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM25AB3EWG3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM25AB3EWG3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM25AB3EWG3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM25AB3EWG3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM25AB3EWG3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM25AB3EWG3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM25AB3EWG3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM25AB3EWG3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM25AB3EWG3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM25AB3EWG3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM25AB3EWG3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM25AB3EWG3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM25AB3EWG3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM25AB3EWG3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM25AB3EWG3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM25AB3EWG3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM25AB3EWG3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM25AB3EWG3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM25AB3EWG3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM25AB3EWG3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM25AB3EWG3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM25AB3EWG3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM25AB3EWG3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM25AB3EWG3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM25AB3EWG3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM25AB3EWG3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM25AB3EWG3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM25AB3EWG3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM25AB3EWG3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms