Protein–RNA interactions for Protein: A8K7I4

CLCA1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA1A8K7I4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA1A8K7I4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCA1A8K7I4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA1A8K7I4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA1A8K7I4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA1A8K7I4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA1A8K7I4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA1A8K7I4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCA1A8K7I4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCA1A8K7I4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCA1A8K7I4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCA1A8K7I4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCA1A8K7I4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCA1A8K7I4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLCA1A8K7I4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLCA1A8K7I4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLCA1A8K7I4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLCA1A8K7I4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCA1A8K7I4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCA1A8K7I4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCA1A8K7I4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCA1A8K7I4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCA1A8K7I4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCA1A8K7I4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCA1A8K7I4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCA1A8K7I4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCA1A8K7I4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLCA1A8K7I4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCA1A8K7I4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCA1A8K7I4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCA1A8K7I4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCA1A8K7I4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA1A8K7I4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA1A8K7I4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA1A8K7I4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA1A8K7I4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCA1A8K7I4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA1A8K7I4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA1A8K7I4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA1A8K7I4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA1A8K7I4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCA1A8K7I4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA1A8K7I4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCA1A8K7I4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA1A8K7I4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA1A8K7I4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA1A8K7I4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA1A8K7I4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA1A8K7I4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCA1A8K7I4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCA1A8K7I4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCA1A8K7I4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCA1A8K7I4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCA1A8K7I4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCA1A8K7I4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCA1A8K7I4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCA1A8K7I4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCA1A8K7I4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCA1A8K7I4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCA1A8K7I4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCA1A8K7I4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCA1A8K7I4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCA1A8K7I4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms